SMP Bina Sejahtera Kota Bogor didirikan pada 15 Februari 1988 berdasarkan Surat Keputusan Pendirian Sekolah Nomor 932/I02/Kep/E.88 dan Surat Keputusan Izin Operasional dengan nomor yang sama. Sekolah ini berstatus swasta di bawah naungan yayasan dan berlokasi di Jl. Ledeng Sindangsari No. 5, Kelurahan Kebon Kalapa, Kecamatan Kota Bogor Tengah, Kota Bogor, Provinsi Jawa Barat, dengan NPSN 20220405 dan NSS 202026104010.

Latar belakang pendirian sekolah ini berakar dari kebutuhan masyarakat Bogor yang pada akhir tahun 1980-an sedang mengalami pertumbuhan penduduk yang pesat, terutama di kawasan padat penduduk seperti Kelurahan Kebon Kalapa. Masyarakat setempat membutuhkan lembaga pendidikan menengah pertama yang tidak hanya menekankan prestasi akademik, tetapi juga pembentukan karakter religius, moral, dan nilai-nilai Pancasila secara utuh. Yayasan pendiri melihat peluang untuk mendirikan sekolah yang mampu menjadi pusat pendidikan agama dan akademik yang integral, sehingga lahir SMP Bina Sejahtera sebagai jawaban atas harapan tersebut.

Sejak awal berdirinya, sekolah telah menempati lahan milik yayasan dengan fasilitas yang terus dikembangkan secara bertahap. Pada masa-masa awal, sekolah beroperasi dengan jumlah rombel dan siswa yang terbatas, namun dengan semangat gotong royong warga sekitar dan komitmen pendidik yang kuat. Tahun demi tahun, sekolah berhasil membangun reputasi sebagai institusi yang memperhatikan keseimbangan antara ilmu pengetahuan, karakter, dan keterampilan hidup. Keberhasilan ini tercermin dari berbagai prestasi non-akademik yang diraih siswa dalam bidang seni, olahraga, dan kegiatan keagamaan.

Pada tahun 2021, sekolah berhasil meraih Akreditasi A dari Badan Akreditasi Nasional Sekolah/Madrasah (BAN-SM) melalui SK Nomor 1347/BAN-SM/SK/2021 tanggal 8 Desember 2021. Hal ini menjadi tonggak penting yang menegaskan komitmen sekolah dalam menjaga dan meningkatkan mutu pendidikan. Saat ini sekolah telah menerapkan Kurikulum Merdeka secara penuh untuk kelas VII, VIII, dan IX, serta aktif berpartisipasi dalam Asesmen Nasional dan Survei Lingkungan Belajar yang hasilnya dituangkan dalam Rapor Pendidikan Tahun 2025.

Lokasi sekolah yang strategis di tengah masyarakat padat penduduk menciptakan sinergi yang sangat erat antara kegiatan belajar-mengajar dengan kehidupan sosial sehari-hari. Sekolah menjadi pusat aktivitas edukasi dan sosial yang mendukung pertukaran nilai positif antara murid, guru, orang tua, dan warga sekitar. Keunggulan sekolah dalam bidang non-akademik beberapa tahun terakhir cukup membanggakan dan merupakan respons langsung terhadap harapan masyarakat akan lembaga pendidikan yang berkualitas, mampu menjamin mutu pendidikan agama dan akademik secara integral.

Dengan jumlah peserta didik sebanyak 275 orang (Kelas VII: 97, VIII: 92, IX: 86), 21 orang pendidik, dan 11 orang tenaga kependidikan, serta sarana-prasarana yang terus dikembangkan (meskipun masih terdapat beberapa ruangan yang perlu direnovasi seperti ruang guru, UKS, dan laboratorium IPA), sekolah terus berkomitmen untuk menjadi sekolah yang religius, cerdas, dan berdaya saing global. Latar belakang dan sejarah ini menjadi dasar kuat bagi penyusunan Rencana Kerja Jangka Menengah (RKJM) Tahun 2026–2030 yang berbasis data Rapor Pendidikan dan 8 Standar Nasional Pendidikan (SNP).